Zakupy w aptece wysyłkowej odbywają się na takich samych zasadach jak w innych sklepach internetowych. Sam proces zakupu nie jest skomplikowany, a w porównaniu z aptekami stacjonarnymi śmiało można określić go jako komfortowy, gdyż dokonywany zazwyczaj z zacisza domowego nie ma przejawów pośpiechu, zatem nie ma obawy, że zapomni się o czymś potrzebnym.
Sposób wyszukiwania niezbędnego medykamentu jest dowolny. Można wyszukiwać go po nazwie preparatu lub po jego przeznaczeniu (na przykład „odchudzanie”) lub przeszukiwać go w skonkretyzowanych pod względem właściwości działania działach. Zazwyczaj pojawią się farmaceutyki kilku producentów, które można przefiltrować pod kątem zawartości poszczególnych składników lub ceny. Odpowiadający preparat należy skierować do wirtualnego koszyka w potrzebnych ilościach, po czym można kontynuować lub zakończyć zakupy, dokonując przy tym wyboru metody płatności i sposobu dostawy. Płatność generowana jest za pomocą karty debetowej lub kredytowej, przelewu bankowego, systemu PayPal, szybkich płatności internetowych lub gotówką za pobraniem. Apteki wysyłkowe proponują między innymi opcje dostawy za pośrednictwem firmy kurierskiej, paczki standardowej, paczkomatów, odbiorów w punkcie lub odbioru osobistego w aptece. Czas dostawy to zazwyczaj dwa – trzy dni robocze, w zależności o której godzinie zamówienie zostało złożone w aptece wysyłkowej.
Apteka wysyłkowa jest przyjaznym miejscem dla swoich klientów. Liczne promocje, znacznie liczniejsze od napotykanych w aptekach „na mieście”, zasługują na szczególną uwagę. Nie ma obawy, że natrafi się na tabliczkę „zamknięte”, gdyż w internecie każda apteka wysyłkowa jest całodobowa.